La gestion des autorisations et des références dans le système de contrôle d'accès ISEO est effectuée par le contrôleur ATLAS, le véritable "cœur" du système. Le contrôleur ATLAS contient les données de tous les dispositifs en ligne et hors ligne et de toutes les autorisations du système.
Plusieurs ATLAS en mode esclave peuvent être installés sur le même système pour gérer différents lecteurs et portes, même géographiquement dispersés.